配合教育部的回流教育政策，本系於民國92年8月經教育部核准後，開設亞太工商管理學系大學部二年制在職專班， 每年招收學生50名。除了傳授最新的管理知識與專業技能、培養具有紀律、創新及前瞻能力的亞太區域工商管理人才之外，更期望能栽培出立志做大事的領導人才。並透過在職專班與大學部的互動與交流，期能培養大學部學生早日具備工作應有的態度與認知，將機會是留給準備好的人。

       自98學年度起開辦碩士在職專班招收15名學生，次年(99學年度)起每年招收學生20名。二年制在職專班因市場需求於同年(99學年度)起停招。並自103學年度起碩士在職專班招生考試免筆試(保留書面審查與面試)入學。